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海南醫(yī)學(xué)院藥物化學(xué)學(xué)科于2005年被確立為海南省重點（扶持）學(xué)科。2010年該學(xué)科再次被評為海南省重點（扶持）學(xué)科。本學(xué)科以海南豐富的熱帶藥用植物（南藥黎藥）為研究對象，開展藥效物質(zhì)基礎(chǔ)研究、新藥開發(fā)及質(zhì)量安全與代謝化學(xué)研究。

本學(xué)科共有教師30余人，其中教授4人，副教授15人，博士學(xué)位獲得者12人，具有碩士以上學(xué)位的人員達到90%以上。

本學(xué)科有實驗和辦公場地近2000平方米，其中專業(yè)實驗室面積近800余平方米，儀器設(shè)備價值達到1000余萬元人民幣。從2008年至今，本學(xué)科獲得國家“十二五”科技支撐計劃子課題2項、國家自然科學(xué)基金4項、海南省和�？谑兄攸c科研課題及省自然科學(xué)基金二十余項，五年內(nèi)可支配的科研經(jīng)費達500余萬元人民幣；獲得授權(quán)國家醫(yī)藥發(fā)明專利2項；取得海南省科技進步二等獎、三等獎各1項；發(fā)表論文141篇，其中SCI、EI、ISTP三大檢索源收錄論文21篇。

自2001年始，已經(jīng)連續(xù)招收、培養(yǎng)藥學(xué)類各層次學(xué)生近3000名，畢業(yè)1000余人，為海南省醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)初步解決了人才短缺的瓶頸問題；此外，通過合作方式，于2001年啟動了研究生教育，已與中國藥科大學(xué)、沈陽藥科大學(xué)和廣州中醫(yī)藥大學(xué)的教授聯(lián)合培養(yǎng)碩博研究生21人，已有10人取得碩士學(xué)位，為獨立招收碩士研究生夯實了工作基礎(chǔ)。