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875生物信息學考試大綱

一、考試內(nèi)容范圍

生物信息學是一門綜合交叉學科，是采用信息科學、計算機科學和數(shù)學等學科的觀點和方法對生命的現(xiàn)象及其組成分子(核酸、蛋白質(zhì)等)進行研究，主要研究生命中的本質(zhì)和規(guī)律，包括物質(zhì)組成、結(jié)構(gòu)功能、生命體的能量和信息交換傳遞等。

知識結(jié)構(gòu)：

★ 生物信息學概論和數(shù)據(jù)庫

★ 序列數(shù)據(jù)的收集和存儲

★ 基因組序列組裝和基因注釋

★ 基因結(jié)構(gòu)元件識別和分析

★ 雙序列與多序列比對

★ 數(shù)據(jù)庫檢索算法

★ 序列變異研究的算法與進化分析

★ 基因表達與調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

★ 表觀遺傳學數(shù)據(jù)分析

★ 蛋白質(zhì)分類與結(jié)構(gòu)預(yù)測

考核內(nèi)容：

了解生物信息學概念、研究方向和發(fā)展趨勢，并熟悉重要的生物信息中心和常用數(shù)據(jù)庫。

了解不同類型序列數(shù)據(jù)的獲取方式，掌握常用的序列存儲格式及轉(zhuǎn)換方式。

掌握常用序列聯(lián)配算法，了解打分矩陣及空位罰分算法，并理解多重序列比對與進化分析的關(guān)系。

理解進化分析與親緣樹的關(guān)系，掌握三種進化分析算法(最大似然法、距離法和最大簡約法)。

掌握轉(zhuǎn)錄組分析基本方法，理解基因表達差異分析的算法。

了解染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)，掌握ChIP-Seq數(shù)據(jù)處理流程和下游分析流程。

掌握蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組成和層次，理解序列相似性與結(jié)構(gòu)相似性同蛋白質(zhì)分類之間的關(guān)系，掌握蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測方法，包括二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)。

二、試卷結(jié)構(gòu)

試卷滿分150分。序列分析算法、數(shù)據(jù)庫搜索工具、進化分析原理約占80分左右，新一代測序數(shù)據(jù)分析、表觀遺傳及相關(guān)生物信息學工具和分析等約占70分。

三、參考書目

陳銘生物信息學科學出版社2018年09月第三版