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2018年遼寧大學研究生考試851生物信息學考試大綱公布如下
遼寧大學
全國碩士研究生招生考試自命題科目考試大綱
考試科目: 生物信息學
一、考試形式和試卷結(jié)構(gòu)
(一)試卷滿分及考試時間
本試卷滿分為 150 分,考試時間為 180 分鐘。
(二)試卷題型結(jié)構(gòu)及分值比例
名詞解釋(約30分);簡答題(約40分);問答題(約50分);論述題(約30分)。
二、考查內(nèi)容
1.生物信息學相關(guān)概念、主要研究方向、相關(guān)發(fā)展簡史、相關(guān)重要事件及發(fā)展趨勢。
2.生物信息學中常用生物數(shù)據(jù)(核酸序列數(shù)據(jù)、蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù))的測定方法,常用的數(shù)據(jù)庫序列數(shù)據(jù)存儲格式。
3.重要的生物信息學網(wǎng)站,重要數(shù)據(jù)庫的使用方法,主要包括核酸數(shù)據(jù)庫、基因組數(shù)據(jù)庫、蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫。生物信息學數(shù)據(jù)庫的相關(guān)概念。
4.遺傳密碼與蛋白合成概念、方法,開放閱讀框的預測方法,真核生物基因預測與外顯子識別關(guān)系的方法,基因序列的注釋方法。
5.序列比對的概念,掌握一致性、相似性、同源性的概念及其之間的區(qū)別,常用的序列比對算法和軟件,常見打分矩陣和空位罰分體系。
6.序列數(shù)據(jù)庫搜索工具BLAST,各種BLAST結(jié)果的含義, BLAST算法的原理及NCBI BLAST各參數(shù)的含義。
7.系統(tǒng)發(fā)育進化樹相關(guān)概念,使用MEGA等軟件構(gòu)建進化樹的方法,三種常見的進化樹構(gòu)建算法(近鄰法、最大簡約法、最大似然法)的概念、原理、方法。
8.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的組成和層次,序列相似性與結(jié)構(gòu)相似性同蛋白質(zhì)分類之間的關(guān)系,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類及相關(guān)數(shù)據(jù)庫。蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的可視化的概念和方法。
9.蛋白質(zhì)家族、蛋白質(zhì)信號及其表示方式,主要包括一致序列、序列模式、多序列聯(lián)配無空位片段、序列譜以及相關(guān)數(shù)據(jù)庫,主要包括Prosite、PRINTS、Pfam等數(shù)據(jù)庫。
10.蛋白質(zhì)序列分析與功能的預測方法,主要包括理化性質(zhì)、跨膜螺旋、信號肽、翻譯后修飾、亞細胞定位等。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測常用方法,包括二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)。
11.基因和蛋白質(zhì)芯片的概念、原理及其主要應用。
12.數(shù)據(jù)挖掘與機器學習的概念,常見機器學習算法。
13.基于結(jié)構(gòu)的藥物設計的概念、方法。
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