中國水產(chǎn)科學研究院作為國家級水產(chǎn)科研機構，擔負著全國漁業(yè)重大基礎、應用研究和高新技術產(chǎn)業(yè)開發(fā)研究的任務，在解決漁業(yè)及漁業(yè)經(jīng)濟建設中基礎性、方向性、全局性、關鍵性重大科技問題，以及科技興漁、培養(yǎng)高層次科研人才、開展國內(nèi)外漁業(yè)科技交流與合作等方面發(fā)揮著重要的作用。                      
   
全院現(xiàn)有海區(qū)研究所3個、流域研究所4個、專業(yè)研究所2個、增殖實驗站4個及院部共14個單位，與地方共建了5個研究機構，分布在全國的12個省、市。全院現(xiàn)有在職職工2027人，其中，在職科技人員1435人。在職科技人員中，擁有副高級以上職稱的研究人員578人；研究生導師178人，其中，博士生導師21人；擁有中國工程院院士3人，國家級、部級有突出貢獻的中青年專家28人，享有政府特殊津貼專家29人，“百千萬人才工程”國家級人選5名，院首席科學家13人。我院科技隊伍已基本形成了由院士、國家級專家、部級專家、院首席科學家以及中青年優(yōu)秀人才組成的層次結構比較合理的科研團隊 。
　
全院共有省部重點開放實驗室9個、院級重點開放實驗室12個，國家級、部級質(zhì)量監(jiān)督檢測中心10個，部級野外觀測臺站9個，國際水產(chǎn)培訓中心2個，科研實驗及中試基地34處，擁有千噸級海洋科學調(diào)查船2艘。

全院研究重點為漁業(yè)資源保護與利用、漁業(yè)生態(tài)環(huán)境、水產(chǎn)生物技術、水產(chǎn)遺傳育種、水產(chǎn)病害防治、水產(chǎn)養(yǎng)殖技術、水產(chǎn)加工與產(chǎn)物資源利用、水產(chǎn)品質(zhì)量安全、漁業(yè)工程與裝備、漁業(yè)信息與發(fā)展戰(zhàn)略等十大領域。

建院以來，我院科技工作者攻克了水產(chǎn)業(yè)持續(xù)發(fā)展中的一系列基礎性、關鍵性技術難題，取得了一大批對漁業(yè)發(fā)展有較大促進作用的成果。1978年建院以來，全院有500多項成果獲國家和省部級獎勵，其中國家獎54項，省、部級獎勵400多項，全院以占全國水產(chǎn)科研單位20%左右的科技人員，獲國家和農(nóng)業(yè)部獎的成果數(shù)量占全國水產(chǎn)行業(yè)的50%以上，水產(chǎn)學科獲得國家科技獎勵一等獎的5項成果中，水科院為主的占4項。

全院已與世界上60多個國家和國際組織的有關單位建立了密切的科技、經(jīng)濟合作關系，為80多個國家和地區(qū)培訓了1200多名高級水產(chǎn)技術和管理人才。