中國科學(xué)院過程工程研究所前身是1958年成立的中國科學(xué)院化工冶金研究所。50多年來，研究范圍逐步擴展到能源化工、生化工程、材料化工、資源/環(huán)境工程等領(lǐng)域，學(xué)科方向由“化工冶金”發(fā)展為“過程工程”。2001年更為現(xiàn)名。

過程工程所面向國家過程工業(yè)戰(zhàn)略需求，面向世界過程工程科技前沿，針對制約過程工業(yè)發(fā)展的共性科技問題，提出了“過程工業(yè)綠色化與信息化”的發(fā)展戰(zhàn)略和“一個核心、四個層次”的科研布局，即以時空多尺度結(jié)構(gòu)為核心，突破關(guān)鍵性科學(xué)難題；在共性問題和方法學(xué)、數(shù)據(jù)信息和實驗計算平臺、工藝和過程調(diào)控、工程應(yīng)用四個層次，系統(tǒng)研究與發(fā)展過程工程科學(xué)，形成資源高效清潔轉(zhuǎn)化和產(chǎn)品高值化制備的過程工程平臺。“一個核心”與“四個層次”是有機、開放的整體，旨在落實戰(zhàn)略目標，突破科研—開發(fā)—設(shè)計—工程/分離的體制機制障礙，促進實驗室成果產(chǎn)業(yè)化，輸出高效清潔的物質(zhì)轉(zhuǎn)化新工藝、新過程/新設(shè)備和集成技術(shù)，帶動過程工業(yè)的技術(shù)升級換代和生產(chǎn)模式根本變革。

過程工程所現(xiàn)有生化工程國家重點實驗室和國家生化工程技術(shù)研究中心（北京）、多相復(fù)雜系統(tǒng)國家重點實驗室、濕法冶金清潔生產(chǎn)技術(shù)國家工程實驗室、中國科學(xué)院綠色過程與工程重點實驗室以及過程工程研發(fā)中心、生物質(zhì)研究中心等科研機構(gòu)。

截至2009年年底，過程工程所共有在職職工356人。其中科技人員246人、科技支撐人員30人，包括中國科學(xué)院院士4人、中國工程院院士1人；研究員56人，副研究員105人；國家海外高層次人才培養(yǎng)計劃（千人計劃）入選者1人、中國科學(xué)院“百人計劃”入選者16人。過程工程所是國務(wù)院學(xué)位委員會批準的首批博士、碩士學(xué)位授予單位之一，設(shè)有“化學(xué)工程與技術(shù)”一級學(xué)科和材料學(xué)、環(huán)境工程兩個二級學(xué)科博士研究生培養(yǎng)點，并設(shè)有1個一級學(xué)科博士后流動站�，F(xiàn)有博士生導(dǎo)師35人、碩士生導(dǎo)師75人，博士研究生214人、碩士研究生188人，在站博士后17人。

2009年，過程工程所共有在研項目365項，其中主持國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃（973）項目3項、參加11項，承擔中國高技術(shù)研究發(fā)展計劃（863）項目36項，國家科技支撐計劃項目16項；國家自然科學(xué)基金項目114項；國家科學(xué)技術(shù)部、環(huán)境保護部等單位重大項目6項；中國科學(xué)院知識創(chuàng)新工程方向項目53項；科研儀器設(shè)備研制項目11項，等等。2009年新增項目60項，其中主持國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃（973）項目1項，參加項目3項；國家自然科學(xué)基金項目32項；中國科學(xué)院知識創(chuàng)新工程方向項目9項；其它項目14項。全年縱向到款1.7億元，較2008年增長60.7%，新增合同留所經(jīng)費1.06億元。

2009年，過程工程所共取得科研成果22項，獲國際、國家、省部級成果獎12項。其中，由毛在砂、陳家鏞、楊超、王躍發(fā)完成的《多相體系的化學(xué)反應(yīng)工程和反應(yīng)器的基礎(chǔ)研究及應(yīng)用》項目，榮獲國家自然科學(xué)二等獎，該項目以30多年的科研積累推動了化學(xué)工程學(xué)科的發(fā)展，為過程工業(yè)設(shè)備的優(yōu)化操作和科學(xué)放大設(shè)計提供了可靠的應(yīng)用基礎(chǔ)，為化工、石油等過程工業(yè)做出了重要貢獻。由馬光輝、蘇志國、王連艷、王佳興、鞏方玲、周青竹完成的《尺寸均一、可控的乳液、微球和微囊的制備技術(shù)》項目，榮獲國家技術(shù)發(fā)明二等獎，該項目發(fā)明了一種全新的乳液、微球和微囊制備技術(shù)，采用微孔膜為介質(zhì)，通過控制分散相與膜孔的界面張力和液滴形成速度，制備出尺寸均一的乳液、微球和微囊，相關(guān)專利技術(shù)及產(chǎn)品已在國內(nèi)外數(shù)十家單位獲得應(yīng)用。由陳洪章與安徽大學(xué)合作完成的《真菌殺蟲劑產(chǎn)業(yè)化及森林害蟲持續(xù)控制技術(shù)》項目，榮獲國家科技進步二等獎，該項目通過生物質(zhì)類高值化的創(chuàng)新技術(shù)體系，在固態(tài)發(fā)酵技術(shù)產(chǎn)業(yè)化和秸稈組分分離及其生物量全利用領(lǐng)域中，成功實施了固態(tài)發(fā)酵純種培養(yǎng)規(guī)�；�與產(chǎn)業(yè)化，江西生產(chǎn)基地的建立改變了我國真菌殺蟲劑商業(yè)產(chǎn)品為零的現(xiàn)狀，帶動了地方經(jīng)濟的發(fā)展，對促進林業(yè)、農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展具有重要的社會意義和經(jīng)濟效益。

2009年，過程工程所科技開發(fā)工作成效顯著。全年共簽訂技術(shù)合同126份，合同金額9100萬元；實現(xiàn)橫向收入4900多萬元，較2008年增長約140%�？萍奸_發(fā)工作形成良好局面，全年與地方政府或企業(yè)開展科技交流活動130余次，與地方政府或企業(yè)新建16個聯(lián)合實驗室或研發(fā)基地；與國內(nèi)相關(guān)行業(yè)的骨干企業(yè)共同組建了太陽能光熱、冶金法太陽能多晶硅、海外有色金屬資源開發(fā)等9個產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新聯(lián)盟；成立了“知識產(chǎn)權(quán)辦公室”，科技開發(fā)工作輻射到全國27個省區(qū)市；廊坊中試基地順利獲得建設(shè)項目三證。多尺度模擬仿真計算技術(shù)逐步在冶金、石化等流程工業(yè)中的得到應(yīng)用，亞熔鹽氧化鋁清潔生產(chǎn)、循環(huán)流化床磁化焙燒處理貧鐵礦、以離子液體技術(shù)為平臺的化工清潔生產(chǎn)、動態(tài)高溫鋼坯防氧化與功能粉體及涂層、生物介質(zhì)及膜乳化法制備微球微囊、纖維素生物質(zhì)制備丁醇、工業(yè)煙氣脫硫、焦化廢水處理等技術(shù)實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化，帶動了我國相關(guān)產(chǎn)業(yè)的技術(shù)創(chuàng)新與進步。

2009年過程工程所國際合作與交流活躍。與研究所長期保持密切合作來自瑞士的洛塔•雷教授被授予“2008年度中華人民共和國國際科學(xué)技術(shù)合作獎”。研究所成功舉辦了第五屆中美化學(xué)工程會議、第二屆中英顆粒技術(shù)論壇等重要國際會議，同時與美國能源部國家能源技術(shù)實驗室、佐治亞理工學(xué)院、佛羅里達磷酸鹽研究所等知名高校和研究機構(gòu)簽訂了合作備忘錄。2009年全所共出訪87人次，來訪282人次。

中國顆粒學(xué)會掛靠過程工程所，所內(nèi)主辦《過程工程學(xué)報》、《顆粒學(xué)報》（PARTICUOLOGY）和《計算機與應(yīng)用化學(xué)》三個學(xué)術(shù)期刊。