中國科學院合肥物質科學研究院（以下簡稱合肥研究院）是中國科學院在安徽設立的一個綜合性科研基地和人才培養(yǎng)基地。合肥研究院位于合肥市西郊風景秀麗的蜀山湖畔的董鋪島上，面積2.65平方公里。島上三面環(huán)水，綠樹成蔭。江澤民總書記1998年蒞臨視察時對這里的科研環(huán)境給予了很高的評價，并欣然題詞“科學島”，由此科學島成為合肥研究院的別名。胡錦濤總書記2008年來島視察時，對科學島科技人員的自主創(chuàng)新能力給予了充分肯定，鼓勵大家不斷提高自主創(chuàng)新能力，始終把握發(fā)展的主動權，增添發(fā)展的新優(yōu)勢。

合肥研究院下屬研究機構有安徽光學精密機械研究所、等離子體物理研究所、固體物理研究所、合肥智能機械研究所、強磁場科學技術中心，另外和安徽省共建了安徽循環(huán)經(jīng)濟技術工程院，以推動產(chǎn)業(yè)研發(fā)。中國科學院在合肥研究院部署的主要學科有等離子體物理與磁約束核聚變、強磁場科學與技術、材料物理與納米技術、大氣光學與遙感、環(huán)境光學與技術、仿生感知與智能系統(tǒng)、激光材料與技術、超導電工與節(jié)能應用、離子束生物工程、智能農(nóng)業(yè)信息技術、太陽能材料與工程等。

隨著科研事業(yè)的發(fā)展，合肥研究院建成了20多個裝備優(yōu)良的實驗室、研究中心和10多個大型技術物理實驗平臺，包括國家“863”計劃大氣光學、智能機器人傳感技術、中科院材料物理、離子束生物工程、安徽省環(huán)境光學監(jiān)測技術等9個國家或省部級重點實驗室，擁有我國第一臺超導托卡馬克HT-7實驗裝置，自主設計、研制了世界上第一臺非圓截面全超導托卡馬克實驗裝置，是中國主要的核聚變研究基地之一，也是世界實驗室在我國設立的核聚變研究中心。

合肥研究院現(xiàn)有在職職工1700余名，其中專業(yè)技術人員1200多人。在現(xiàn)有的140多名研究員中，有院士、國家“973”計劃首席專家兩名、國家“863”計劃專家和大科學工程專家、杰出青年基金獲得者、“百人計劃”入選者等50余人。

合肥研究院設有等離子體物理、核聚變工程、材料物理、光學、大氣物理與大氣環(huán)境等5個博士學位授予點、11個碩士學位授予點和5個博士后流動站，是國家研究生重點培養(yǎng)單位，目前在學博士、碩士研究生1100余名。