南京理工大學研究生教育始于1978年，現(xiàn)有18個博士學位一級學科授權點，116個碩士學位授權點，有工程碩士專業(yè)學位、EMBA、MBA、MPA、高校教師在職攻讀碩士學位、在職人員以同等學力申請博士、碩士學位的授予權。

目前學校研究生導師1115人（其中博士生導師407人），各類在籍研究生12000余人。

2014年擬招收碩士研究生2480人。