2014年，中國科學院上海藥物研究所計劃在藥物化學、藥理學、藥物分析學、藥劑學、藥物設(shè)計學等五個專業(yè)招收學術(shù)型碩士學位研究生88名左右，在制藥工程、藥學碩士二個專業(yè)招收全日制專業(yè)學位碩士研究生10名左右。另代上�？萍即髮W招收學術(shù)型碩士學位研究生25名左右，總計招研究生123人作用。資料顯示，中國科學院上海藥物研究所碩士生錄取類別分為非定向就業(yè)和定向就業(yè)兩種，定向就業(yè)的碩士研究生均須在復試時與學校、用人單位簽訂定向委托培養(yǎng)合同。

資料顯示，中國科學院上海藥物研究所是藥學一級學科博士、碩士學位培養(yǎng)單位，擁有新藥研究國家重點實驗室、國家新藥篩選中心、中藥標準化技術(shù)國家工程實驗室等三個國家級實驗室，設(shè)有藥物化學合成研究室、天然藥物化學研究室、藥理學第一研究室、藥理學第二研究室，藥理學第三研究室等五個研究室，并建有藥物發(fā)現(xiàn)與設(shè)計中心、藥效評價研究中心、藥物安全評價研究中心、藥物代謝研究中心、藥物釋放系統(tǒng)研究中心、中藥現(xiàn)代化研究中心、常州藥物研究開發(fā)中心等一系列新藥研發(fā)技術(shù)平臺以及分析化學室、實驗動物室、圖書情報室和期刊聯(lián)合編輯部等支撐部門；主辦了英文學術(shù)雜志Asian Journal of Andrology和Acta Pharmacologica Sinica，并主辦以非處方藥物為主的科普雜志《家庭用藥》。